暗号とWikipediaを心から愛する少年はある日、ある瞬間を境に別の小さな少女の身体になって目を覚ます。そこは別の世界で文明のレベルまで低い。何より魔法が実在するファンタジーな世界だった。見知らぬ世界で魔法を解析しながら平穏な暮らしを続けていたが、かつての戦争を引き摺る一団によって父親を失う。そんな少女の元へ戦乱の種が次々と舞い込んできてしまい……。大切な地と約束を守る為に少女は別世界の知識を使い改革を始めた矢先、再び敵が攻めてきた。敵との兵力差は約66倍。絶望的な差を現代の知識で補い、からくも勝利を手にした少女は束の間の平穏を享受するが、少女の持つ知識はさらなる戦乱を巻き起こしていく。陰謀を巡らせていたのは遥か遠い海の先にある帝国。襲いかかる膨大な量の艦隊を前に、少女は再び戦場に立つ。