アキラは、ほぼ日雇いの雑用で生活する少女だった。
　彼女はその日も、手先が器用なだけでは、と解雇を言い渡される。途方に暮れつつ帰宅したアキラは、しばし凹むものの、日課である祖父からの課題を解くこととした。

　この世界には『機巧』という『古代の文明』があり、祖父はそれを弄るのが好きだった。
　幼い頃から彼の背中を見て育ったアキラも、同じく機巧弄りが好きになり、弟子入りを志願したのである。そして最後の最後に残されたのが、小箱を開ける、という課題だった。

　そしてついに、アキラはその小箱を開くことに成功する。
　すると、そんな彼女に宿ったのは物の『構造理解』という能力だった。

　唯一無二の能力を使って、少女は『最高の機巧技術師』となる。
　そして人々を助けるうちに、精霊王や神々から愛されるようになるのだった。