西暦2342年。
とある難病だと診断された青年『クロノ』はコールドスリープによって、300年という月日が流れ去った世界で目を覚ます。
だが、冷凍ポッドを管理していた地下施設は放棄されており、探索中、正体不明の怪物に遭遇してしまう。最終的にクロノは、上層、中層、下層の多層構造で造られた要塞都市『ネオみなとみらい』に流れ着き、傭兵として生きていくことになる。
クロノはそこで得た経験と、正体不明の不思議な【ノイズ】、そして知恵だけをふり絞ってこの世界を生き抜いていく。

旧題『クロノスレクイエム』