１９９９年８月、大東亜戦争を戦い抜いて戦後BC戦犯として服役した一人の老人が老衰のため、天に召されようとした時に不思議な事が起きて気が付くと昭和２０年代に戻ると共に姿形も当時のままであった。

　その軍人の名は『日下敏夫』海軍中佐で世界初の潜水空母“伊４００”の艦長であると共に僚艦の“伊４０１”“伊１３”“伊１４”と共にパナマ運河攻撃出撃前夜であった。

　しかし彼の記憶には、パナマ運河の代わりにウルシー環礁攻撃に変わったはずだがこの世界と彼がいた世界は微妙に違う世界である。

　それから運命に導かれて未来の世界へジャンプした後、そこで別次元の兵器に生まれ変わった潜水艦“伊４００”は、別世界の日本国滅亡を阻止する為に最新鋭護衛艦である“さがみ”と共に再び過去に戻り大暴れをして日本国滅亡が決定されている運命を破壊する事である。