2095年、テクノロジーが極限まで発展し、貧富の差が拡大した未来の東京――。

ある日、記憶を失った現代の少年・ヴェルは、目を覚ますと見知らぬ巨大都市の片隅に立っていた。彼の持ち物は壊れたスマホ一台と財布のみ。戸惑う彼の前に現れたのは、未来人の少女・葵（あおい）。彼女はヴェルを助け、共に彼の過去と、この都市の真実を探る旅に出る。

高度なネットワークシステム「シナプス」に支配された社会では、情報や記憶さえも統制され、人々は仮想空間に依存して生きている。都市の表層は美しく整備されているが、裏側では貧困と格差が広がっていた。

色々あった末に二人は、都市に隠された闇と、ヴェルの過去に関わる重大な秘密に直面する。

彼はなぜ未来に現れたのか。
この東京は、どこへ向かっているのか。
そして、二人の出会いが導く未来とは――。