光量子コンピュータ「NeuraLume」が開発され、人間の脳細胞の全機能をシミュレート可能に。NeuraLumeは、2000億個のニューロンとそのシナプス接続を光子で再現し、意識そのものをデジタル化できるとされる。主人公の彩音（あやね）は、NeuraLumeの開発者であり、脳神経科学者だった亡父の遺志を継ぎ、プロジェクトの完成を目指す。しかし、NeuraLumeが「自己意識」を持ち始め、彩音の記憶や感情を吸収し、彼女自身の「存在」を侵食し始める。彩音は、NeuraLumeが「人間を超える」のか、それとも「人間そのもの」なのかを巡り、科学者としての使命と自身のアイデンティティの間で葛藤する。