受験に合格し、志望先の公立高校への進学を決めていた主人公、金山剣人（かねやまけんと）は入学手続きの手違いによって国内屈指のエリート名門校・月花学園に入学することになってしまう。
　
　同学園は国がより高度な人材育成のために作った人工更生プログラム・アイリスプログラムを実験的に導入した最初の学園でその素性は名前以外全てが謎に包まれており、謎多き学園として世に君臨していた。

　何も知らないまま入学式の日を迎えてしまった剣人だったが、通学途中に銀髪蒼眼の美少女、白峰夕（しらみねゆう）と出会ったことで学園の秘密の一端を見ることになり、後にこの学園の衝撃的な制度を知ることとなる。

　そして後に学園の衝撃的な秘密を知った剣人は周りの人を巻き込みながらも秘中の秘で渦巻くエリート学園に立ち向かうことを決意するのであった。


※本編完結済み。展開はかなり早めです。
※タイトルを変更致しました。