２２××年。日本は、まさかの神が神隠しに遭う、という未曽有の危機に瀕していた。
神祇省陰陽寮はこれを緊急事態と見て、陰陽寮の長である飛鳥井シンジに出動を命じる。
飛鳥井は「金の君」と呼ばれる神の婿であり、トップクラスの陰陽師。愛する妻を神隠しの魔の手から守るべく戦うも、相打ちで命を落としてしまった。

そんな彼が生まれ変わったのは、神々が攫われた先の異世界。
魔法がすべての世界で彼は魔力無しと判明し、家族から追放の憂き目にあった。
魔力がないのは当然、陰陽師が使うのは霊力である。
魔法が使えなくても飛鳥井には陰陽の術と、金の君と共に編み出した剣術があった。
かくして飛鳥井は、連れ去られた神々を助けて日本へ帰るべく旅に出る――。

神が異世界に転移し、主人公が異世界転生。誘拐犯から神を取り戻せ！